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MEME網(wǎng)站怎么用(MEME教程)

網(wǎng)站建設(shè)2年前 (2023-01-19)1157

今天給各位分享MEME網(wǎng)站怎么用的知識(shí),其中也會(huì)對(duì)MEME教程進(jìn)行解釋,如果能碰巧解決你現(xiàn)在面臨的問題,別忘了關(guān)注本站,現(xiàn)在開始吧!

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基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析(二)

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基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析(一)

基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析(二)

通過上一部分的分析得到了以下數(shù)據(jù):

接下來利用獲得的這些數(shù)據(jù)進(jìn)行 可視化 。

1.motif分析

meme: ;方法參見 MEME 在線網(wǎng)站查找motif步驟

2.基因結(jié)構(gòu),同樣適用TBtools

3.構(gòu)樹

TBtools合并以上三個(gè)分析:

參考:

01 MEME 在線網(wǎng)站查找motif步驟

02 [軟件使用] 使用TBtools重新繪制MEME motif圖 ;tid=2312highlight=MEME

03 TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(2)基因家族成員的基本分析

meme是什么項(xiàng)目

MEME 是如何開始的?MEME 從 Consensys 開發(fā)人員喬丹?萊爾 (Jordan Lyall) 的一條諷刺推文開始,他在推文中嘲笑了「食品幣」的迅速出現(xiàn)。在推文中,他通過 Notion 制作了一張圖片模型,描述了一個(gè)名為「The Degenerator」的項(xiàng)目構(gòu)想。這個(gè)項(xiàng)目的網(wǎng)站允許人們通過拖拽的方式,在幾分鐘內(nèi)啟動(dòng)一個(gè)新的 DeFi 項(xiàng)目。MEME(菠蘿)初次問世在推文中,他給這個(gè)虛構(gòu)的項(xiàng)目標(biāo)記起了一個(gè)名字: MEME。他完全不知道,在他的推文發(fā)出幾個(gè)小時(shí)后,有匿名人士真的創(chuàng)建了 MEME 代幣。瘋狂的市場(chǎng)使得「空氣幣」MEME 當(dāng)天的成交量就到達(dá)了 120 萬美金,最低價(jià)為 6 美金,最高價(jià)為 40 美金。MEME 經(jīng)歷了什么?從項(xiàng)目開始發(fā)布之時(shí)起,MEME 就像擁有了自己的生命一樣。受到營(yíng)銷炒作和 MEME 文化的刺激,愛好者在 Telegram 中組織了一個(gè) MEME 的自治社區(qū),還將檢查持倉等治理措施融入其中,社區(qū)之中也有幾個(gè)人表示有興趣將這個(gè)虛構(gòu)的項(xiàng)目發(fā)展成為一個(gè)真正的產(chǎn)品。然而,盡管困難重重,這個(gè)項(xiàng)目在社區(qū)的推動(dòng)下慢慢變成了完全不同于之前諷刺模型中的東西。不是一鍵發(fā)幣,如今的它變成了 DeFi 和 NFT 的集合體。今天的 MEME 是什么?簡(jiǎn)而言之,MEME 如今是一個(gè)用于 farming 的 NFT 去中心化平臺(tái)。farming 指的是在新的 DeFi 平臺(tái)中,以 stake 的方式獲得本平臺(tái)的治理令牌的行為。DeFi 項(xiàng)目使用它來吸引和激勵(lì)早期使用者。Non-fungible tokens(NFT)定義了一種生態(tài)中不可分割的、具有唯一性的代幣交互和流通的接口規(guī)范。同質(zhì)化代幣,例如 ETH,并不是唯一的,每個(gè) ETH 等價(jià)且無法區(qū)分開,而每個(gè) NFT 是可驗(yàn)證且唯一的。NFT 由于其非同質(zhì)化、不可拆分的特性,使其可以被用于一些需要確認(rèn)稀缺性和數(shù)字所有權(quán)的應(yīng)用中。NFT 使我們能夠?qū)⑷我庥袃r(jià)值的事物通證化,并追溯該信息的所有權(quán),這樣就實(shí)現(xiàn)了信息與價(jià)值的交匯。NFT 概念在 CryptoKitties(加密貓)時(shí)流行開來,最近 NFT 的熱度正在不斷上升,而 MEME 恰到好處的抓住了這一點(diǎn)。交易平臺(tái) opensea 上 MEME NFT 的交易情況使用 MEME,用戶不是像大多數(shù) DeFi 項(xiàng)目那樣為了收益而 farming,而是通過 stake 或者提供流動(dòng)性挖礦的 LP 來 stake 獲取菠蘿積分,可以用這些積分兌換平臺(tái)上提供的 NFT。平臺(tái)中的 NFT 有不同的稀有程度,如「普通」,「稀有」,稀有程度決定了需要消耗多少菠蘿積分。極其罕見的「Legendary(傳奇)」類別只有在為 Uniswap 上的 MEME/ETH 交易對(duì)提供流動(dòng)性并在 MEME 平臺(tái) stake LP 代幣的情況下,才能獲取。這個(gè) farming pool 叫做 Genesis LP,而標(biāo)準(zhǔn)的叫做 Genesis。這種機(jī)制制造了人為的稀缺性,并讓圍繞在某些 NFT 上的炒作成為了可能。同時(shí)因?yàn)檫@些 NFT 是以太坊的代幣,它們可以立即在二級(jí)市場(chǎng)上交易。例如,有一個(gè)人在 NFT 市場(chǎng) OpenSea 上以 77ETH 的價(jià)格出售了他 farming 的「?jìng)髌妗筍ergey Nazarov 的卡片,并將其部分收益捐給了 MEME 項(xiàng)目的財(cái)務(wù)部門。有趣的是,所有 28,000 個(gè)的 MEME 都被空投給了早期使用者,沒有新的 MEME 會(huì)被創(chuàng)造或挖出。這意味著 NFT 的生產(chǎn)手段完全掌握在 MEME 代幣持有者手中。只有代幣持有者才能獲得新生的 MEME NFT,所有其他人都必須在二級(jí)市場(chǎng)上購(gòu)買。MEME 協(xié)議是 DeFi 和藝術(shù)交叉的一個(gè)有趣的項(xiàng)目?,F(xiàn)在還為時(shí)尚早,但 NFT 的潛力是巨大的,我們很高興看到這個(gè)協(xié)議將如何發(fā)展。

windows怎么應(yīng)用memecached

Memcached 是一個(gè)高性能的分布式內(nèi)存對(duì)象緩存系統(tǒng),用于動(dòng)態(tài)Web應(yīng)用以減輕數(shù)據(jù)庫負(fù)載。它通過在內(nèi)存中緩存數(shù)據(jù)和對(duì)象來減少讀取數(shù)據(jù)庫的次數(shù),從而提供動(dòng)態(tài)、數(shù)據(jù)庫驅(qū)動(dòng)網(wǎng)站的速度。Memcached基于一個(gè)存儲(chǔ)鍵/值對(duì)的hashmap。其守護(hù)進(jìn)程(daemon )是用C寫的,但是客戶端可以用任何語言來編寫,并通過memcached協(xié)議與守護(hù)進(jìn)程通信。但是它并不提供冗余(例如,復(fù)制其hashmap條目);當(dāng)某個(gè)服務(wù)器S停止運(yùn)行或崩潰了,所有存放在S上的鍵/值對(duì)都將丟失。

下載Windows的Server端

安裝Memcache Server(也可以不安裝直接啟動(dòng))

1. 下載memcached的windows穩(wěn)定版,解壓放某個(gè)盤下面,比如在c:\memcached

2. 在CMD下輸入 "c:\memcached\memcached.exe -d install" 安裝.

3. 再輸入:"c:\memcached\memcached.exe -d start" 啟動(dòng)。NOTE: 以后memcached將作為windows的一個(gè)服務(wù)每次開機(jī)時(shí)自動(dòng)啟動(dòng)。這樣服務(wù)器端已經(jīng)安裝完畢了。

如果下載的是二進(jìn)制的版本,直接運(yùn)行就可以了,可以加上參數(shù)來加以設(shè)置。

常用設(shè)置:

-p num 監(jiān)聽的端口

-l ip_addr 連接的IP地址, 默認(rèn)是本機(jī)

-d start 啟動(dòng)memcached服務(wù)

-d restart 重起memcached服務(wù)

-d stop|shutdown 關(guān)閉正在運(yùn)行的memcached服務(wù)

-d install 安裝memcached服務(wù)

-d uninstall 卸載memcached服務(wù)

-u username 以u(píng)sername的身份運(yùn)行 (僅在以root運(yùn)行的時(shí)候有效)

-m num 最大內(nèi)存使用,單位MB。默認(rèn)64MB

-M 內(nèi)存耗盡時(shí)返回錯(cuò)誤,而不是刪除項(xiàng)

-c num 最大同時(shí)連接數(shù),默認(rèn)是1024

-f factor 塊大小增長(zhǎng)因子,默認(rèn)是1.25

-n bytes 最小分配空間,key+value+flags默認(rèn)是48

-h 顯示幫助

如何使用SPDE進(jìn)行基因家族分析---蛋白結(jié)構(gòu)域、啟動(dòng)子元件、保守結(jié)構(gòu)域

在進(jìn)化樹建完后,需要對(duì)序列的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。這里需要區(qū)分兩個(gè)概念,即蛋白結(jié)構(gòu)域與保守結(jié)構(gòu)域,它們兩個(gè)不是一回事。從上一章,通過pfam方法同學(xué)們可以獲得蛋白結(jié)構(gòu)域的信息(即結(jié)構(gòu)域的名字,從哪兒開始到哪兒結(jié)束),而保守結(jié)構(gòu)域,它指的是在你所輸入的這些序列中保守的序列是哪些。至于這些保守的序列到底能不能到蛋白結(jié)構(gòu)域(即可以預(yù)測(cè)有功能的結(jié)構(gòu)域)的那個(gè)層次還不好說。

保守結(jié)構(gòu)域通過meme網(wǎng)站( MEME - Submission form (meme-suite.org) ):

選擇要檢測(cè)出多少保守結(jié)構(gòu)域

選擇text格式:

接下來開始繪圖:

需要基因id以及每個(gè)基因的長(zhǎng)度(即輸入到meme網(wǎng)站的那些~):

需要格式化meme的結(jié)果同時(shí)也需要這些基因的ID, ID的獲?。?/p>

格式化meme:

這些文件都是自動(dòng)完成,大家只需要點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)就好:

繪圖:

這樣就完成了保守結(jié)構(gòu)域的繪制。且每單擊一次default colors, 顏色都會(huì)自動(dòng)配置一次,然后再度點(diǎn)擊draw即可完成顏色的更改。其他參數(shù)參照之前的說明。上一張圖吧:

在上一章講到的pfam的結(jié)果可用于提取蛋白結(jié)構(gòu)域。建議同學(xué)們:如果你的文件里,基因名字過于復(fù)雜,就是含有額外信息,建議大家利用格式化的功能將這些額外去除掉,因?yàn)檫@些額外信息在后續(xù)的分析中基本不會(huì)用到但如果保留它們則會(huì)對(duì)后續(xù)的一些分析產(chǎn)生干擾。

這里要注意一個(gè)問題,如果所研究的家族有多個(gè)結(jié)構(gòu)域,需要依次對(duì)它們的pfam結(jié)果進(jìn)行格式化。格式化的結(jié)果類似于這樣:

之后將該結(jié)果合并在一起(就是直接復(fù)制粘貼)以及上一步的基因ID+長(zhǎng)度的那個(gè)文件輸入作圖模塊中進(jìn)行作圖即可。

再就是啟動(dòng)子元件的展示。需要提取啟動(dòng)子序列,功能在這里:

執(zhí)行此功能,同學(xué)們需要注意一個(gè)問題,就是你蛋白序列文件中的ID可能與gff3文件里的ID有出入,需要稍微調(diào)整,例如:

通過比較可以發(fā)現(xiàn)蛋白文件中的多了“.p” 而gff文件中的多了“.v1.ABR2.1”,因此需要進(jìn)行替換(就是一定要保證蛋白文件中的ID與gff文件中mRNA那一行對(duì)應(yīng)的ID是一樣的),替換功能在這里:

當(dāng)然,同學(xué)們?nèi)绻涣?xí)慣用SPDE也可以用其他軟件例如word替換,這里設(shè)置的替換功能,真正的用處是在執(zhí)行多個(gè)關(guān)鍵詞同時(shí)替換的時(shí)候,這種單個(gè)關(guān)鍵詞的替換,完全展現(xiàn)不出威力~。替換完成后,如下:

這個(gè)文件將作為提取啟動(dòng)子的關(guān)鍵詞。對(duì)基因組序列文件進(jìn)行格式化:

提取的啟動(dòng)子如下:

將啟動(dòng)子放到plantcare( PlantCARE, a database of plant promoters and their cis-acting regulatory elements (ugent.be) )進(jìn)行啟動(dòng)子序列的分析。

這里有個(gè)點(diǎn)兒需要注意:一個(gè)基因的啟動(dòng)子上有很多元件,如果將這些元件都展示在啟動(dòng)子上會(huì)將圖整的跟食品包裝袋后的條碼似的,這并不利于我們展示重點(diǎn)想要展示的東西,因此,這里需要同學(xué)們根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪M(jìn)行刪減,例如,如果同學(xué)們想要展示的是脅迫條件下的情況,則可以將一些無關(guān)元件(如TATA等)刪除,只保留重點(diǎn)先要展示的,這樣也使得我們的研究結(jié)果一目了然。具體操作步驟與之前相同:

結(jié)果:

接下來是展示內(nèi)含子和外顯子的分布情況,當(dāng)然還是要先處理文件,需要的是基因ID和GFF文件:

得到的文件如下:

之后畫圖

嗯,大致是這樣子的吧

同學(xué)們?cè)谧龅臅r(shí)候如果基因數(shù)量多,大可考慮將這些基因分成幾組展示~

meme是啥意思

meme圖是各個(gè)領(lǐng)域帶文字的梗圖。

meme是一個(gè)網(wǎng)絡(luò)流行語。指在同一個(gè)文化氛圍中,人與人之間傳播的思想、行為或者風(fēng)格。譯為“模因”、“迷因”等,但通常被直接稱為“meme”。

作為一種流行的、以衍生方式復(fù)制傳播的互聯(lián)網(wǎng)文化基因,米姆最初誕生時(shí)候具有匿名作者、較低娛樂性的特征,曾經(jīng)風(fēng)靡網(wǎng)絡(luò)的綠豆蛙和兔斯基等卡通形象及其衍生作品,都可視作國(guó)內(nèi)互聯(lián)網(wǎng)米姆現(xiàn)象的萌芽。另指雅虎西班牙語微博網(wǎng)站。

b站上的meme是什么意思

b站上的meme意思是指在同一個(gè)文化氛圍中,人與人之間傳播的思想、行為或者風(fēng)格。

一個(gè)常見的meme應(yīng)當(dāng)是如圖所示的,根據(jù)一些有意思的圖片來配上文字,以達(dá)到令人意想不到卻發(fā)現(xiàn)圖文完全契合的效果。(所以meme也被翻譯為“梗圖”。)這種基于圖片的形式保留了巨大的創(chuàng)作空間,讓每個(gè)人都可以做出屬于自己的meme。

廣義上是指在同一個(gè)文化氛圍中,人與人之間傳播的思想、行為或者風(fēng)格。譯為“模因”、“迷因”等,但通常被直接稱為“meme”?,F(xiàn)在多用于指一些傳播性很強(qiáng)的圖片或視頻。主要流行于歐美國(guó)家。其實(shí)在很多國(guó)家都能找到類似的文化。

如中國(guó)的表情包,日本的日式冷笑話等。牛津字典中,meme的音標(biāo)為?/mim/?。大概類似于“米姆”。

B站介紹

B站一般指嗶哩嗶哩。 嗶哩嗶哩(NASDAQ:BILI;HKEX:9626),英文名稱:bilibili,簡(jiǎn)稱B站,是中國(guó)年輕世代高度聚集的文化社區(qū)和視頻網(wǎng)站,該網(wǎng)站于2009年6月26日創(chuàng)建,被網(wǎng)友們親切地稱為“B站”。

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