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meme suite —— Motif分析百寶箱(二)
Motif Discovery中還包括MEME-ChIP,可對ChIP-seq或CLIP-seq數(shù)據(jù)的DNA序列進行一系列的Motif分析。該方法整合了:
1、MEMESTREME功能,用以預(yù)測Motif(de novo Motif);
2、CentriMo用以尋找輸入序列中間區(qū)段內(nèi)已知的Motif,適合ChIP-Seq數(shù)據(jù)檢出峰所在序列上富集的已知 Motif;
3、通過工具Tomtom功能比較已知的motif進行相似性分析,并對重要的motif進行分組;
4、Spamo與CentriMo功能相似,也是對Motif進行富集;
5、FIMO功能旨在輸出Motif在基因的位置信息。
MEME-ChIP具體參數(shù)可以使用默認值,或按需求更改。示意圖如下:
我們以網(wǎng)站Sample Output中MEME-ChIP example結(jié)果為例進行說明。
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國際貿(mào)易實務(wù)思政化教學(xué)改革理論依據(jù)主要涉及四個方面。首先,結(jié)合建構(gòu)主義學(xué)習(xí)觀,從國際貿(mào)易實務(wù)的課程學(xué)習(xí)來看,學(xué)生在學(xué)習(xí)過程中應(yīng)該主動去構(gòu)建信息,這樣才能激發(fā)學(xué)生的內(nèi)在驅(qū)動力,同時,通過挖掘國際貿(mào)易實務(wù)中的思政因素,將國際貿(mào)易實務(wù)的專業(yè)知識技能與真實情境中的人文社會活動有效結(jié)合;其次,基于實用主義的教育理論,將國際貿(mào)易實務(wù)的專業(yè)知識與學(xué)生的實際生活產(chǎn)生鏈接,生活即教育,要讓學(xué)生掌握知識遷移的能力,從實際生活教育角度出發(fā),內(nèi)化學(xué)生的成長;再次,成果導(dǎo)向的教育明確指出,教學(xué)過程中的教學(xué)設(shè)計和教學(xué)實施目標都應(yīng)以學(xué)生最終的學(xué)習(xí)成果為中心,制定教學(xué)方案并持續(xù)改進。國際貿(mào)易實務(wù)的課程學(xué)習(xí)最終要達到的學(xué)習(xí)成果應(yīng)是學(xué)生的專業(yè)知識技能與思政雙全,因此,在教學(xué)目標和教學(xué)活動的設(shè)計上都要增加思政化目標,站在學(xué)生的角度,以學(xué)生的實際需求為出發(fā)點,構(gòu)建多維度學(xué)習(xí)要素,使學(xué)生從中能夠挖掘自身價值,完成自我目標;最后,基于人的全面發(fā)展理論,國際貿(mào)易實務(wù)課程應(yīng)在注重學(xué)科教學(xué)基礎(chǔ)上同步提升學(xué)生的態(tài)度及道德等綜合素養(yǎng),才符合當(dāng)今教育的思政化趨勢,才能培養(yǎng)出知識技能與道德修養(yǎng)雙修的復(fù)合型人才。
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