meme網(wǎng)站怎么預(yù)測(meme結(jié)果怎么分析)
今天給各位分享meme網(wǎng)站怎么預(yù)測的知識,其中也會對meme結(jié)果怎么分析進(jìn)行解釋,如果能碰巧解決你現(xiàn)在面臨的問題,別忘了關(guān)注本站,現(xiàn)在開始吧!
本文目錄一覽:
- 1、b站上的meme是什么意思
- 2、如何使用SPDE進(jìn)行基因家族分析---蛋白結(jié)構(gòu)域、啟動子元件、保守結(jié)構(gòu)域
- 3、meme suite —— Motif分析百寶箱(二)
- 4、meme幣菠蘿可靠嗎
b站上的meme是什么意思
b站上的meme意思是指在同一個文化氛圍中,人與人之間傳播的思想、行為或者風(fēng)格。
一個常見的meme應(yīng)當(dāng)是如圖所示的,根據(jù)一些有意思的圖片來配上文字,以達(dá)到令人意想不到卻發(fā)現(xiàn)圖文完全契合的效果。(所以meme也被翻譯為“梗圖”。)這種基于圖片的形式保留了巨大的創(chuàng)作空間,讓每個人都可以做出屬于自己的meme。
廣義上是指在同一個文化氛圍中,人與人之間傳播的思想、行為或者風(fēng)格。譯為“模因”、“迷因”等,但通常被直接稱為“meme”?,F(xiàn)在多用于指一些傳播性很強(qiáng)的圖片或視頻。主要流行于歐美國家。其實在很多國家都能找到類似的文化。
如中國的表情包,日本的日式冷笑話等。牛津字典中,meme的音標(biāo)為?/mim/?。大概類似于“米姆”。
B站介紹
B站一般指嗶哩嗶哩。 嗶哩嗶哩(NASDAQ:BILI;HKEX:9626),英文名稱:bilibili,簡稱B站,是中國年輕世代高度聚集的文化社區(qū)和視頻網(wǎng)站,該網(wǎng)站于2009年6月26日創(chuàng)建,被網(wǎng)友們親切地稱為“B站”。
如何使用SPDE進(jìn)行基因家族分析---蛋白結(jié)構(gòu)域、啟動子元件、保守結(jié)構(gòu)域
在進(jìn)化樹建完后,需要對序列的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。這里需要區(qū)分兩個概念,即蛋白結(jié)構(gòu)域與保守結(jié)構(gòu)域,它們兩個不是一回事。從上一章,通過pfam方法同學(xué)們可以獲得蛋白結(jié)構(gòu)域的信息(即結(jié)構(gòu)域的名字,從哪兒開始到哪兒結(jié)束),而保守結(jié)構(gòu)域,它指的是在你所輸入的這些序列中保守的序列是哪些。至于這些保守的序列到底能不能到蛋白結(jié)構(gòu)域(即可以預(yù)測有功能的結(jié)構(gòu)域)的那個層次還不好說。
保守結(jié)構(gòu)域通過meme網(wǎng)站( MEME - Submission form (meme-suite.org) ):
選擇要檢測出多少保守結(jié)構(gòu)域
選擇text格式:
接下來開始繪圖:
需要基因id以及每個基因的長度(即輸入到meme網(wǎng)站的那些~):
需要格式化meme的結(jié)果同時也需要這些基因的ID, ID的獲取:
格式化meme:
這些文件都是自動完成,大家只需要點點點就好:
繪圖:
這樣就完成了保守結(jié)構(gòu)域的繪制。且每單擊一次default colors, 顏色都會自動配置一次,然后再度點擊draw即可完成顏色的更改。其他參數(shù)參照之前的說明。上一張圖吧:
在上一章講到的pfam的結(jié)果可用于提取蛋白結(jié)構(gòu)域。建議同學(xué)們:如果你的文件里,基因名字過于復(fù)雜,就是含有額外信息,建議大家利用格式化的功能將這些額外去除掉,因為這些額外信息在后續(xù)的分析中基本不會用到但如果保留它們則會對后續(xù)的一些分析產(chǎn)生干擾。
這里要注意一個問題,如果所研究的家族有多個結(jié)構(gòu)域,需要依次對它們的pfam結(jié)果進(jìn)行格式化。格式化的結(jié)果類似于這樣:
之后將該結(jié)果合并在一起(就是直接復(fù)制粘貼)以及上一步的基因ID+長度的那個文件輸入作圖模塊中進(jìn)行作圖即可。
再就是啟動子元件的展示。需要提取啟動子序列,功能在這里:
執(zhí)行此功能,同學(xué)們需要注意一個問題,就是你蛋白序列文件中的ID可能與gff3文件里的ID有出入,需要稍微調(diào)整,例如:
通過比較可以發(fā)現(xiàn)蛋白文件中的多了“.p” 而gff文件中的多了“.v1.ABR2.1”,因此需要進(jìn)行替換(就是一定要保證蛋白文件中的ID與gff文件中mRNA那一行對應(yīng)的ID是一樣的),替換功能在這里:
當(dāng)然,同學(xué)們?nèi)绻涣?xí)慣用SPDE也可以用其他軟件例如word替換,這里設(shè)置的替換功能,真正的用處是在執(zhí)行多個關(guān)鍵詞同時替換的時候,這種單個關(guān)鍵詞的替換,完全展現(xiàn)不出威力~。替換完成后,如下:
這個文件將作為提取啟動子的關(guān)鍵詞。對基因組序列文件進(jìn)行格式化:
提取的啟動子如下:
將啟動子放到plantcare( PlantCARE, a database of plant promoters and their cis-acting regulatory elements (ugent.be) )進(jìn)行啟動子序列的分析。
這里有個點兒需要注意:一個基因的啟動子上有很多元件,如果將這些元件都展示在啟動子上會將圖整的跟食品包裝袋后的條碼似的,這并不利于我們展示重點想要展示的東西,因此,這里需要同學(xué)們根據(jù)自己的實驗?zāi)康倪M(jìn)行刪減,例如,如果同學(xué)們想要展示的是脅迫條件下的情況,則可以將一些無關(guān)元件(如TATA等)刪除,只保留重點先要展示的,這樣也使得我們的研究結(jié)果一目了然。具體操作步驟與之前相同:
結(jié)果:
接下來是展示內(nèi)含子和外顯子的分布情況,當(dāng)然還是要先處理文件,需要的是基因ID和GFF文件:
得到的文件如下:
之后畫圖
嗯,大致是這樣子的吧
同學(xué)們在做的時候如果基因數(shù)量多,大可考慮將這些基因分成幾組展示~
meme suite —— Motif分析百寶箱(二)
Motif Discovery中還包括MEME-ChIP,可對ChIP-seq或CLIP-seq數(shù)據(jù)的DNA序列進(jìn)行一系列的Motif分析。該方法整合了:
1、MEMESTREME功能,用以預(yù)測Motif(de novo Motif);
2、CentriMo用以尋找輸入序列中間區(qū)段內(nèi)已知的Motif,適合ChIP-Seq數(shù)據(jù)檢出峰所在序列上富集的已知 Motif;
3、通過工具Tomtom功能比較已知的motif進(jìn)行相似性分析,并對重要的motif進(jìn)行分組;
4、Spamo與CentriMo功能相似,也是對Motif進(jìn)行富集;
5、FIMO功能旨在輸出Motif在基因的位置信息。
MEME-ChIP具體參數(shù)可以使用默認(rèn)值,或按需求更改。示意圖如下:
我們以網(wǎng)站Sample Output中MEME-ChIP example結(jié)果為例進(jìn)行說明。
meme幣菠蘿可靠嗎
不可靠。
Meme是以Meme文化為基礎(chǔ)的加密貨幣。與比特幣(BTC)和以太坊(ETH)等主要加密貨幣相比,它的波動性相對來說比較高。這可能是因為Meme幣是嚴(yán)重受社區(qū)驅(qū)動的代幣。它們的價格通常受到社交媒體和在線社區(qū)情緒的影響。這往往帶來很多波動,但也帶來FOMO和金融風(fēng)險。雖然確實有一些投資者通過Meme幣發(fā)了財,但也有許多人由于市場波動或者投資一些詐騙性的代幣而賠了錢。
拓展資料:
1、MEME,因為它的圖標(biāo)是一個菠蘿,也有人管它叫菠蘿幣。這個菠蘿幣之前也做過免費(fèi)的空投,一個人是空投了350個MEME。這個菠蘿幣最高時漲到1900美元一個,相當(dāng)于每個人空投了66萬美元,將近500萬人民幣!
2、MEME從Consensys開發(fā)人員喬丹萊爾 (Jordan Lyall) 的一條諷刺推文開始,他在推文中嘲笑了“食品幣”的迅速出現(xiàn)。在推文中,他通過Notion制作了一張圖片模型,描述了一個名為“The Degenerator”的項目構(gòu)想。這個項目的網(wǎng)站允許人們通過拖拽的方式,在幾分鐘內(nèi)啟動一個新的DeFi項目。
3、在推文中,他給這個虛構(gòu)的項目標(biāo)記起了一個名字: MEME。他完全不知道,在他的推文發(fā)出幾個小時后,有匿名人士真的創(chuàng)建了MEME代幣。瘋狂的市場使得“空氣幣”MEME當(dāng)天的成交量就到達(dá)了120萬美元。在此之后,MEME在社區(qū)的推動下逐步融入了NFT(非同質(zhì)化通證)元素,并在之后的空投中,迎來了令人為之顫抖的暴漲。
4、由此來看,雖然不知道哪個空投的幣會暴漲。但是,只要有空投,我們就抽空參與一下。這樣的話,遇到暴漲代幣的可能性就會變大,除此之外,我們在選擇空投幣種的時候,還需要看看空投代幣背后的故事和背景,比如MEME這種既有諷刺又有NFT要素的代幣就是一個很好的例證。
關(guān)于meme網(wǎng)站怎么預(yù)測和meme結(jié)果怎么分析的介紹到此就結(jié)束了,不知道你從中找到你需要的信息了嗎 ?如果你還想了解更多這方面的信息,記得收藏關(guān)注本站。
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